ну вообще по габаритам ракет их как раз можно напихать огромную кучу, это не проблема. Например на Петре Великом если не ошибаюсь скромно так 96 ракеток С-300 помимо основного вооружения. И если эти подводные ракеты специально проектировать, то засунуть их энное количество в подводную лодку — плевое дело. Самая главная проблема это РЛС конечно.

Ну как вариант — внешнее наведение. С самолета, береговой станции, через спутник, мало ли вариантов. Незаметно высунуть приемную антенну с глубины 20 м куда проще, чем полноценную РЛС. Причем тут необязательно даже передавать весь набор данных, достаточно простой команды: ракета ПВО в количестве стольки-то штук — огонь! А уж после выходы их из воды каждая ракета получает полноценные указания на цель, лодка же спокойно себе драпает с места пуска.